El tribunal esta compuesto por un orden jurisdiccional penal con dos salas, la Sala de lo Penal y la Sala de Apelación, un orden jurisdiccional contencioso-administrativo con la Sala de lo Contencioso-Administrativo y un orden jurisdiccional social con la Sala de lo Social. No cuenta con sala de lo civil al no poseer competencia civil.
La Audiencia Nacional en materia laboral, conocerá en única instancia de los procesos especiales de impugnación de convenios colectivos cuyo ámbito territorial de aplicación sea superior al territorio de una Comunidades Autónomas y de otras materias.
Como órgano judicial oridinario, la Audiencia Nacional es orgánica y funcionalmente reconocida por la Comisión Europea de Derechos Humanos. Es un tribunal ordinario instituido por un Real Decreto-ley y compuesto de Magistrados nombrados por el Consejo General del Poder Judicial“.
Esta conformada por:
* su Presidente,
* los Presidentes de Sala
* los magistrados que determine la ley para cada una de sus Salas y Secciones.
El Presidente de la Audiencia Nacional, que tendrá la consideración de Presidente de Sala del Tribunal Supremo, es el Presidente nato de todas sus Salas.
La Audiencia Nacional no se ocupará en ningún caso de los temas referentes en materia de diplomacia, jurisprudencia geográfica entre países, inmigración, entre otras. Por ejemplo, para el tema migratorio deberá contar con una firma de abogados de inmigracion con amplia experiencia que conozca las leyes de cada países donde exista interés de emigrar.
El 17 de septiembre de 2009 la Audiencia Nacional procesó a tres nazis por complicidad en genocidio y lesa humanidad:
Eran tres ex guardias de las SS conocidos con los nombres de Johann Leprich, Anton Tittjung, Josias Kumpf. Se les dictó orden internacional de detención gracias a denuncias interpuestas contra ellos por varios supervivientes de campos de concentración nazis.
El juez a cargo es el señor Ismael Moreno quien acordo el procesamiento de los tres ex guardias y ordenó su prision provisional, comunicada e incondicional. El magistrado de la Audiencia Nacional atiende la petición de la Fiscalía, que el pasado 29 de mayo presentó un escrito solicitando que estos tres hombres fueran procesados como autores de un delito en grado de cómplices.
